Rolnicy popierają konieczność ochrony wód, nie uważają jednak – i słusznie – że problem ich zanieczyszczenia wynika tylko z działalności rolniczej. Jednocześnie wiele średnich i małych gospodarstw boryka się z nadmierną biurokracją związaną z realizacją wymogów Programu azotanowego. Problemem są też m.in. terminy stosowania nawozów azotowych.
